Το ΚΒΙΕΣ εδρεύει στο Στρδο «Κουτσούκου», εντός του κτιρίου του 414 ΣΝΕΝ. Το τμήμα της Διεύθυνσης Στρατιωτικών Σκύλων (Κτηνιατρική Κλινική-Τμήμα Εκπαίδευσης),
έχει αναπτυχθεί στο Στρατόπεδο «ΚΑΡΑΪΣΚΑΚΗ Α΄» (Χαϊδάρι Αττικής).
Η αποστολή του ΚΒΙΕΣ είναι:
Υγειονομικός και τεχνολογικός- ποιοτικός έλεγχος των κάθε είδους τροφίμων που προορίζονται για τις Ένοπλες Δυνάμεις, από τα πρώτα στάδια της επεξεργασίας μέχρι την κατανάλωση, καθώς και του νερού.
Έλεγχος του περιβάλλοντος σε σχέση με ραδιολογικές, χημικές και βιολογικές ρυπάνσεις συμπεριλαμβανομένων και των ασύμμετρων απειλών, σε συνεργασία με στρατιωτικούς και πολιτικούς φορείς κατά περίπτωση.
Υγειονομική και εκπαιδευτική υποστήριξη στρατιωτικά εργαζόμενων σκύλων. Η παροχή Υγειονομικής υποστήριξης αφορά και στους υπηρεσιακούς σκύλους Πολεμικού Ναυτικού, Ελληνικής Αστυνομίας,
Πυροσβεστικού Σώματος, Λιμενικού Σώματος και Εθνικής Υπηρεσίας Πληροφοριών.
Για την επίτευξη της αποστολής του, το ΚΒΙΕΣ διαθέτει:
Α. Εργαστήρια Ελέγχου Τροφίμων και Νερών (Μικροβιολογικό, Χημικό, Ιστολογικό, Παρασιτολογικό) και Τμήμα Περιβαλλοντολογικού Ελέγχου, τα οποία εδρεύουν
στο Στρατόπεδο «ΚΟΥΤΣΟΥΚΟΥ» (Παλαιά Πεντέλη Αττικής).
Β. Κτηνιατρική Κλινική και Τμήμα Υποστήριξης Στοιχείων ΣΕΣ-Σ, με έδρα το Στρατόπεδο «ΚΑΡΑΪΣΚΑΚΗ Α΄» (Χαϊδάρι Αττικής).
